Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul7Q8VE73 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cul7Q8VE73 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cul7Q8VE73 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cul7Q8VE73 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cul7Q8VE73 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul7Q8VE73 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul7Q8VE73 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul7Q8VE73 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul7Q8VE73 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul7Q8VE73 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul7Q8VE73 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul7Q8VE73 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul7Q8VE73 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul7Q8VE73 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul7Q8VE73 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul7Q8VE73 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul7Q8VE73 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul7Q8VE73 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul7Q8VE73 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul7Q8VE73 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul7Q8VE73 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul7Q8VE73 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul7Q8VE73 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul7Q8VE73 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul7Q8VE73 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms