Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg8Q8VE18 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg8Q8VE18 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms