Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Uhrf1Q8VDF2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Uhrf1Q8VDF2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Uhrf1Q8VDF2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Uhrf1Q8VDF2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Uhrf1Q8VDF2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Uhrf1Q8VDF2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Uhrf1Q8VDF2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Uhrf1Q8VDF2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Uhrf1Q8VDF2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Uhrf1Q8VDF2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Uhrf1Q8VDF2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uhrf1Q8VDF2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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