Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam20bQ8VCS3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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