Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sgms1Q8VCQ6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Sgms1Q8VCQ6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgms1Q8VCQ6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgms1Q8VCQ6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgms1Q8VCQ6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgms1Q8VCQ6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sgms1Q8VCQ6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgms1Q8VCQ6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgms1Q8VCQ6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgms1Q8VCQ6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgms1Q8VCQ6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms