Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Vmn1r200Q8R281 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Vmn1r200Q8R281 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Vmn1r200Q8R281 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Vmn1r200Q8R281 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Vmn1r200Q8R281 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Vmn1r200Q8R281 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Vmn1r200Q8R281 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r200Q8R281 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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