Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K4

Ccdc137, Coiled-coil domain-containing protein 137, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc137Q8R0K4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc137Q8R0K4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms