Protein–RNA interactions for Protein: Q8K363

Ddx18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx18Q8K363 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Ddx18Q8K363 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Ddx18Q8K363 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Ddx18Q8K363 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ddx18Q8K363 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ddx18Q8K363 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ddx18Q8K363 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ddx18Q8K363 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ddx18Q8K363 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ddx18Q8K363 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx18Q8K363 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms