Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud6bQ8K2H2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud6bQ8K2H2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms