Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Mtmr3Q8K296 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mtmr3Q8K296 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mtmr3Q8K296 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mtmr3Q8K296 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mtmr3Q8K296 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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Mtmr3Q8K296 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mtmr3Q8K296 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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Mtmr3Q8K296 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
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Mtmr3Q8K296 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Mtmr3Q8K296 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Mtmr3Q8K296 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Mtmr3Q8K296 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mtmr3Q8K296 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Mtmr3Q8K296 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mtmr3Q8K296 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mtmr3Q8K296 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mtmr3Q8K296 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mtmr3Q8K296 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mtmr3Q8K296 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mtmr3Q8K296 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mtmr3Q8K296 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mtmr3Q8K296 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mtmr3Q8K296 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mtmr3Q8K296 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mtmr3Q8K296 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mtmr3Q8K296 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mtmr3Q8K296 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mtmr3Q8K296 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Mtmr3Q8K296 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mtmr3Q8K296 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mtmr3Q8K296 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mtmr3Q8K296 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms