Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Abcf3Q8K268 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Abcf3Q8K268 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Abcf3Q8K268 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Abcf3Q8K268 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Abcf3Q8K268 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Abcf3Q8K268 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Abcf3Q8K268 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Abcf3Q8K268 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Abcf3Q8K268 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Abcf3Q8K268 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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