Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sde2Q8K1J5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sde2Q8K1J5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms