Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Cldn34c1Q8K193 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Cldn34c1Q8K193 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Cldn34c1Q8K193 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Cldn34c1Q8K193 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Cldn34c1Q8K193 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Cldn34c1Q8K193 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Cldn34c1Q8K193 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Cldn34c1Q8K193 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Cldn34c1Q8K193 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn34c1Q8K193 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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