Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgbQ8K0E8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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