Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE4

Parp10, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp10Q8CIE4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp10Q8CIE4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Parp10Q8CIE4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms