Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Upp2Q8CGR7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms