Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.6 ms