Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClasrpQ8CFC7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms