Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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