Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms