Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CcinQ8CDE2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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CcinQ8CDE2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CcinQ8CDE2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcinQ8CDE2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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