Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Aph1bQ8C7N7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Aph1bQ8C7N7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Aph1bQ8C7N7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Aph1bQ8C7N7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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