Protein–RNA interactions for Protein: Q8C156

Ncaph, Condensin complex subunit 2, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcaphQ8C156 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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NcaphQ8C156 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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NcaphQ8C156 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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NcaphQ8C156 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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NcaphQ8C156 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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NcaphQ8C156 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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NcaphQ8C156 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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NcaphQ8C156 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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NcaphQ8C156 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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NcaphQ8C156 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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NcaphQ8C156 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcaphQ8C156 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms