Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Atg16l1Q8C0J2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Atg16l1Q8C0J2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg16l1Q8C0J2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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