Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms