Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx16Q8C080 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms