Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Iffo1Q8BXL9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Iffo1Q8BXL9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Iffo1Q8BXL9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Iffo1Q8BXL9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Iffo1Q8BXL9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Iffo1Q8BXL9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Iffo1Q8BXL9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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