Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn17Q8BXA6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms