Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp38Q8BW70 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms