Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

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Length 718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gga3Q8BMI3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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