Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem87bQ8BKU8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem87bQ8BKU8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms