Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Usp1Q8BJQ2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp1Q8BJQ2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms