Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG19

Tmtc4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc4Q8BG19 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmtc4Q8BG19 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmtc4Q8BG19 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms