Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc50Q810U5 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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