Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc172Q810N9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms