Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Smim19Q80ZU4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Smim19Q80ZU4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Smim19Q80ZU4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms