Protein–RNA interactions for Protein: Q80YA8

Crb2, Protein crumbs homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb2Q80YA8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crb2Q80YA8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crb2Q80YA8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms