Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm5bQ80Y84 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Kdm5bQ80Y84 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm5bQ80Y84 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm5bQ80Y84 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm5bQ80Y84 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm5bQ80Y84 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm5bQ80Y84 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm5bQ80Y84 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm5bQ80Y84 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm5bQ80Y84 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm5bQ80Y84 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm5bQ80Y84 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm5bQ80Y84 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm5bQ80Y84 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm5bQ80Y84 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm5bQ80Y84 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm5bQ80Y84 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm5bQ80Y84 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm5bQ80Y84 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms