Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nrde2Q80XC6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms