Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Zbed4Q80WQ9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Zbed4Q80WQ9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Zbed4Q80WQ9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Zbed4Q80WQ9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Zbed4Q80WQ9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Zbed4Q80WQ9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms