Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp8Q80U87 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp8Q80U87 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp8Q80U87 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp8Q80U87 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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