Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms