Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clec18aQ7TSQ1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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