Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms