Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc2bQ7TPM1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms