Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms