Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms