Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms