Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sox11Q7M6Y2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sox11Q7M6Y2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sox11Q7M6Y2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sox11Q7M6Y2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sox11Q7M6Y2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sox11Q7M6Y2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sox11Q7M6Y2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sox11Q7M6Y2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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Sox11Q7M6Y2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sox11Q7M6Y2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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