Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms